Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL16A1Q07092 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms