Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 YJL032WYJL032W 315 nt1.89□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YLR050CYLR050C 486 nt1.89□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YKE2YLR200W 345 nt1.89□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 IGO1YNL157W 507 nt1.89□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 ESF2YNR054C 951 nt1.89□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 TYE7YOR344C 876 nt1.89□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 MRPL40YPL173W 894 nt1.89□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.89□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YPR014CYPR014C 330 nt1.89□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 SLM4YBR077C 489 nt1.89□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 APL5YPL195W 2799 nt1.89□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 NEO1YIL048W 3456 nt1.89□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 NUP100YKL068W 2880 nt1.88□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YLR108CYLR108C 1458 nt1.88□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 GUK1YDR454C 564 nt1.88□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 RPL22BYFL034C-A 369 nt1.88□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt1.88□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YKL069WYKL069W 543 nt1.88□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YIP3YNL044W 531 nt1.88□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.88□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YPP1YGR198W 2454 nt1.88□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 RUB1YDR139C 234 nt1.87□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YER046W-AYER046W-A 330 nt1.87□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt1.87□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 MAK11YKL021C 1407 nt1.87□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YLR169WYLR169W 354 nt1.87□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YBL062WYBL062W 381 nt1.87□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 NGL1YOL042W 1092 nt1.87□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YPL142CYPL142C 318 nt1.87□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 NTC20YBR188C 423 nt1.87□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 JJJ2YJL162C 1752 nt1.87□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 KAR1YNL188W 1302 nt1.87□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 NAB6YML117W 3405 nt1.87□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 HOS4YIL112W 3252 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 INO80YGL150C 4470 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 RAV1YJR033C 4074 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 SRD1YCR018C 666 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 SEC31YDL195W 3822 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 CUP1-1YHR053C 186 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 CUP1-2YHR055C 186 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YLR257WYLR257W 966 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 FPR1YNL135C 345 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 VAM3YOR106W 852 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 MSS18YPR134W 807 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 MUD1YBR119W 897 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 NUR1YDL089W 1455 nt1.86□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 SPT14YPL175W 1359 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 SVP26YHR181W 687 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YIL012WYIL012W 342 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 AIM23YJL131C 1071 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 ASG7YJL170C 630 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 PSY1YKL076C 384 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YKL115CYKL115C 393 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 PAU8YAL068C 363 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 MRPS8YMR158W 468 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 PAU20YOL161C 363 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YOR366WYOR366W 354 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 ESA1YOR244W 1338 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 SET2YJL168C 2202 nt1.85□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 SRB4YER022W 2064 nt1.84□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 APC11YDL008W 498 nt1.84□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 SLD5YDR489W 885 nt1.84□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 TWF1YGR080W 999 nt1.84□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 NOP19YGR251W 591 nt1.84□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt1.84□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 CMC1YKL137W 336 nt1.84□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 CSI2YOL007C 1026 nt1.84□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YOL107WYOL107W 1029 nt1.84□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 YOL162WYOL162W 648 nt1.84□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 HUA2YOR284W 732 nt1.84□□□□□ -2.11
NEJ1Q06148 ARP5YNL059C 2268 nt1.84□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt1.84□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt1.84□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 HRD3YLR207W 2502 nt1.83□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 MRPL32YCR003W 552 nt1.83□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 KEI1YDR367W 666 nt1.83□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 VAB2YEL005C 849 nt1.83□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 LSM12YHR121W 564 nt1.83□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt1.83□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 CRS5YOR031W 210 nt1.83□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 HEM4YOR278W 828 nt1.83□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 PET20YPL159C 762 nt1.83□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 CUP9YPL177C 921 nt1.83□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 snR24snR24 89 nt1.83□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 DIS3YOL021C 3006 nt1.83□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 TRM2YKR056W 1920 nt1.83□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 PDS5YMR076C 3834 nt1.82□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 BRE5YNR051C 1548 nt1.82□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 ERG28YER044C 447 nt1.82□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.82□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 OST5YGL226C-A 261 nt1.82□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 GTR2YGR163W 1026 nt1.82□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 CTK2YJL006C 972 nt1.82□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 ATG10YLL042C 504 nt1.82□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 YLR224WYLR224W 1110 nt1.82□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 UBC12YLR306W 567 nt1.82□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 ASI3YNL008C 2031 nt1.82□□□□□ -2.12
NEJ1Q06148 MAL33YBR297W 1407 nt1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.4 ms