Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIN1Q05586 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms