Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT17Q04695 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms