Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ATP7AQ04656 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATP7AQ04656 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms