Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 MDM36YPR083W 1740 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 MUS81YDR386W 1899 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YCR108CYCR108C 192 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 SLU7YDR088C 1149 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 SAE2YGL175C 1038 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 SUS1YBR111W-A 291 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 SGS1YMR190C 4344 nt2.48□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 VPS3YDR495C 3036 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 PBP4YDL053C 558 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 VMA21YGR105W 234 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YGR290WYGR290W 444 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 RPF1YHR088W 888 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 BET4YJL031C 984 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YOL114CYOL114C 609 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 RPC40YPR110C 1008 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YPR177CYPR177C 372 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 POL4YCR014C 1749 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.47□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 RVS161YCR009C 798 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 snR9snR9 187 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YDR220CYDR220C 294 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 VMA10YHR039C-A 345 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 SDL1YIL167W 633 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 ASG7YJL170C 630 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YJR141WYJR141W 1044 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YJR157WYJR157W 363 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 MPD2YOL088C 834 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 TRS20YBR254C 528 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 PEX5YDR244W 1839 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YBR259WYBR259W 2067 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 AVT5YBL089W 1380 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YKR078WYKR078W 1758 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 DIA2YOR080W 2199 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 SYO1YDL063C 1863 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 PEX6YNL329C 3093 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 NUM1YDR150W 8247 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 GYL1YMR192W 2163 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 NET1YJL076W 3570 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YCR013CYCR013C 648 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 snR84snR84 550 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 FIN1YDR130C 876 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 RSM24YDR175C 960 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 NCB2YDR397C 441 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 SLD5YDR489W 885 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 ATP6Q0085 780 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YGL039WYGL039W 1047 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 VEL1YGL258W 621 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YHR212CYHR212C 336 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YHR213WYHR213W 597 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YIL141WYIL141W 390 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YKL066WYKL066W 444 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YAR060CYAR060C 336 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YAR062WYAR062W 597 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 SWS2YNL081C 432 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 KTI11YBL071W-A 249 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 MIX23YBL107C 591 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 CSM4YPL200W 471 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 MNT3YIL014W 1893 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 MUB1YMR100W 1863 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YCL020WYCL020W 1317 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 PSK1YAL017W 4071 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 SMC6YLR383W 3345 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 TOM70YNL121C 1854 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 MRD1YPR112C 2664 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YDR262WYDR262W 819 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 GET1YGL020C 708 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 LCL2YLR104W 396 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YLR379WYLR379W 375 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 UBX4YMR067C 1251 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 VHR1YIL056W 1923 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 LST4YKL176C 2487 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 OSW7YFR039C 1533 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 EXO84YBR102C 2262 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 RPL17BYJL177W 555 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 SRP21YKL122C 504 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 PDR17YNL264C 1053 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YOR050CYOR050C 348 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YOR277CYOR277C 309 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 RRD2YPL152W 1077 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 NOP12YOL041C 1380 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 MET6YER091C 2304 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 GUP1YGL084C 1683 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 ARP8YOR141C 2646 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 PDC2YDR081C 2778 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 ANR2YKL047W 1551 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 SRD1YCR018C 666 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 YDR115WYDR115W 318 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 NTF2YER009W 378 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS1Q03785 THG1YGR024C 714 nt2.42□□□□□ -2.02
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