Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms