Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHDQ02161 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHDQ02161 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHDQ02161 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHDQ02161 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHDQ02161 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHDQ02161 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHDQ02161 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHDQ02161 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHDQ02161 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHDQ02161 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHDQ02161 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHDQ02161 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHDQ02161 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHDQ02161 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHDQ02161 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHDQ02161 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms