Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms