Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD4Q01804 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD4Q01804 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD4Q01804 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD4Q01804 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD4Q01804 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD4Q01804 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD4Q01804 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD4Q01804 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD4Q01804 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD4Q01804 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD4Q01804 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms