Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42EP1Q00587 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP1Q00587 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms