Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms