Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG7P83436 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG7P83436 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG7P83436 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG7P83436 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG7P83436 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COG7P83436 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG7P83436 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG7P83436 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG7P83436 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG7P83436 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG7P83436 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG7P83436 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG7P83436 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COG7P83436 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG7P83436 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG7P83436 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG7P83436 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG7P83436 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COG7P83436 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COG7P83436 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COG7P83436 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COG7P83436 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COG7P83436 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG7P83436 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG7P83436 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG7P83436 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COG7P83436 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COG7P83436 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms