Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HBBP68871 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HBBP68871 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HBBP68871 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBBP68871 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms