Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL11P62913 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL11P62913 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL11P62913 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms