Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GNB1P62873 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GNB1P62873 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GNB1P62873 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GNB1P62873 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GNB1P62873 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GNB1P62873 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB1P62873 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms