Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113P62684 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms