Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms