Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms