Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB2AP61019 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms