Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4BP61018 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms