Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCCD1P59942 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms