Protein–RNA interactions for Protein: P59901

LILRA4, Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA4P59901 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LILRA4P59901 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LILRA4P59901 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms