Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB25P57735 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB25P57735 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB25P57735 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB25P57735 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB25P57735 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB25P57735 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB25P57735 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB25P57735 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB25P57735 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB25P57735 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB25P57735 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB25P57735 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB25P57735 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB25P57735 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB25P57735 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB25P57735 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB25P57735 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB25P57735 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms