Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF3P57682 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF3P57682 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF3P57682 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF3P57682 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF3P57682 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF3P57682 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF3P57682 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF3P57682 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms