Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBASH3AP57075 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms