Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP7P55210 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP7P55210 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP7P55210 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CASP7P55210 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP7P55210 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP7P55210 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP7P55210 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP7P55210 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP7P55210 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP7P55210 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP7P55210 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP7P55210 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP7P55210 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP7P55210 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP7P55210 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP7P55210 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms