Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD23BP54727 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms