Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA2P54646 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms