Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRAP54198 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRAP54198 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRAP54198 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRAP54198 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRAP54198 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRAP54198 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRAP54198 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRAP54198 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRAP54198 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRAP54198 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRAP54198 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRAP54198 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRAP54198 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRAP54198 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRAP54198 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRAP54198 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRAP54198 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRAP54198 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRAP54198 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRAP54198 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRAP54198 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRAP54198 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRAP54198 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRAP54198 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRAP54198 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRAP54198 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRAP54198 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRAP54198 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRAP54198 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HIRAP54198 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HIRAP54198 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRAP54198 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRAP54198 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRAP54198 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRAP54198 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRAP54198 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRAP54198 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRAP54198 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRAP54198 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRAP54198 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRAP54198 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRAP54198 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HIRAP54198 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms