Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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PGGT1BP53609 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PGGT1BP53609 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PGGT1BP53609 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PGGT1BP53609 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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