Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOSBP53539 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSBP53539 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSBP53539 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSBP53539 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSBP53539 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSBP53539 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSBP53539 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSBP53539 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOSBP53539 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOSBP53539 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOSBP53539 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOSBP53539 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOSBP53539 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOSBP53539 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSBP53539 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSBP53539 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSBP53539 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSBP53539 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSBP53539 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSBP53539 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSBP53539 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSBP53539 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSBP53539 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSBP53539 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSBP53539 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSBP53539 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOSBP53539 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOSBP53539 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOSBP53539 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOSBP53539 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOSBP53539 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOSBP53539 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOSBP53539 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOSBP53539 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms