Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms