Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC3P51654 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC3P51654 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC3P51654 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC3P51654 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC3P51654 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC3P51654 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC3P51654 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC3P51654 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC3P51654 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC3P51654 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC3P51654 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC3P51654 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC3P51654 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC3P51654 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC3P51654 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC3P51654 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC3P51654 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC3P51654 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC3P51654 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC3P51654 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC3P51654 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC3P51654 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC3P51654 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC3P51654 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC3P51654 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC3P51654 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC3P51654 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC3P51654 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPC3P51654 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPC3P51654 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms