Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SMARCA4P51532 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms