Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATMP50440 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATMP50440 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATMP50440 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATMP50440 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATMP50440 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATMP50440 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATMP50440 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATMP50440 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATMP50440 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATMP50440 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATMP50440 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATMP50440 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATMP50440 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATMP50440 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATMP50440 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATMP50440 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATMP50440 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATMP50440 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATMP50440 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATMP50440 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATMP50440 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATMP50440 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATMP50440 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATMP50440 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATMP50440 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATMP50440 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATMP50440 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATMP50440 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATMP50440 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms