Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSEN2P49810 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms