Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTCFP49711 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTCFP49711 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTCFP49711 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTCFP49711 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTCFP49711 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTCFP49711 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTCFP49711 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTCFP49711 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTCFP49711 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTCFP49711 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTCFP49711 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTCFP49711 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTCFP49711 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTCFP49711 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTCFP49711 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTCFP49711 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTCFP49711 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTCFP49711 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms