Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC6A9P48067 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms