Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms