Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP5P45974 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP5P45974 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP5P45974 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP5P45974 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP5P45974 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP5P45974 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP5P45974 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP5P45974 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP5P45974 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP5P45974 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP5P45974 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP5P45974 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP5P45974 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP5P45974 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP5P45974 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP5P45974 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP5P45974 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP5P45974 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP5P45974 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP5P45974 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP5P45974 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP5P45974 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP5P45974 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP5P45974 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP5P45974 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP5P45974 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP5P45974 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP5P45974 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP5P45974 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP5P45974 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP5P45974 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP5P45974 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms