Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFMP43652 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AFMP43652 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFMP43652 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFMP43652 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFMP43652 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AFMP43652 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AFMP43652 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFMP43652 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFMP43652 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFMP43652 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AFMP43652 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFMP43652 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFMP43652 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFMP43652 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFMP43652 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFMP43652 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AFMP43652 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFMP43652 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms