Protein–RNA interactions for Protein: P42127

ASIP, Agouti-signaling protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIPP42127 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASIPP42127 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASIPP42127 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASIPP42127 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASIPP42127 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASIPP42127 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASIPP42127 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASIPP42127 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASIPP42127 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASIPP42127 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASIPP42127 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASIPP42127 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASIPP42127 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASIPP42127 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASIPP42127 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms