Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms