Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MDH1P40925 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MDH1P40925 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MDH1P40925 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MDH1P40925 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MDH1P40925 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDH1P40925 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDH1P40925 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDH1P40925 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDH1P40925 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDH1P40925 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDH1P40925 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDH1P40925 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDH1P40925 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDH1P40925 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDH1P40925 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MDH1P40925 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MDH1P40925 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MDH1P40925 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDH1P40925 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDH1P40925 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDH1P40925 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MDH1P40925 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms