Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 SDC25YLL016W 3147 nt2.35□□□□□ -2.03
SHQ1P40486 YIL080WYIL080W 4722 nt2.34□□□□□ -2.03
SHQ1P40486 RTG3YBL103C 1461 nt2.34□□□□□ -2.03
SHQ1P40486 YNL018CYNL018C 1839 nt2.34□□□□□ -2.03
SHQ1P40486 MRP10YDL045W-A 288 nt2.34□□□□□ -2.03
SHQ1P40486 RUB1YDR139C 234 nt2.34□□□□□ -2.03
SHQ1P40486 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.34□□□□□ -2.03
SHQ1P40486 ATP7YKL016C 525 nt2.34□□□□□ -2.03
SHQ1P40486 YKL069WYKL069W 543 nt2.34□□□□□ -2.03
SHQ1P40486 SCY1YGL083W 2415 nt2.34□□□□□ -2.03
SHQ1P40486 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt2.34□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt2.34□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YPK1YKL126W 2043 nt2.34□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 NUR1YDL089W 1455 nt2.33□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 SRD1YCR018C 666 nt2.33□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YRB1YDR002W 606 nt2.33□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YGR050CYGR050C 357 nt2.33□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YKE2YLR200W 345 nt2.33□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 RPL25YOL127W 429 nt2.33□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 ASI3YNL008C 2031 nt2.33□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 ROY1YMR258C 1662 nt2.33□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 TRS130YMR218C 3309 nt2.33□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 UTP22YGR090W 3714 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 SSY1YDR160W 2559 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YFH1YDL120W 525 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 RPL27BYDR471W 411 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 GCN4YEL009C 846 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 RPS24AYER074W 408 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YIL012WYIL012W 342 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 POL32YJR043C 1053 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 VPS51YKR020W 495 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 ATG10YLL042C 504 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YLL044WYLL044W 447 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YLR169WYLR169W 354 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 GPN3YLR243W 819 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 ICY1YMR195W 384 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 NTC20YBR188C 423 nt2.32□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 SRP1YNL189W 1629 nt2.31□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 KEI1YDR367W 666 nt2.31□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 SLD5YDR489W 885 nt2.31□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.31□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 CTK2YJL006C 972 nt2.31□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.31□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 CMC1YKL137W 336 nt2.31□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YRO2YBR054W 1035 nt2.31□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 CST9YLR394W 1449 nt2.31□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 ALK2YBL009W 2031 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 PIB1YDR313C 861 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 TIF35YDR429C 825 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 OST5YGL226C-A 261 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 PET191YJR034W 327 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YNL046WYNL046W 519 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YOL162WYOL162W 648 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 HUA2YOR284W 732 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 VMA9YCL005W-A 222 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 APA1YCL050C 966 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 SPT14YPL175W 1359 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 MAL33YBR297W 1407 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 ARP5YNL059C 2268 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 HOS4YIL112W 3252 nt2.3□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 TOF1YNL273W 3717 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 GIS1YDR096W 2685 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 MGM1YOR211C 2646 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 BRE1YDL074C 2103 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 BRE5YNR051C 1548 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 TOR2YKL203C 7425 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 ATC1YDR184C 885 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 SRB7YDR308C 423 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 TIM9YEL020W-A 264 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 COG2YGR120C 789 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 SMD3YLR147C 306 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 RPL16BYNL069C 597 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 MSS18YPR134W 807 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 snR191snR191 274 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 KOG1YHR186C 4674 nt2.29□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 FUS1YCL027W 1539 nt2.28□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 SCH9YHR205W 2475 nt2.28□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 RGL1YPL066W 1440 nt2.28□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 VAB2YEL005C 849 nt2.28□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.28□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 GPX1YKL026C 504 nt2.28□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YKL115CYKL115C 393 nt2.28□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.28□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 RBL2YOR265W 321 nt2.28□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 HEM4YOR278W 828 nt2.28□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 PET20YPL159C 762 nt2.28□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 YEL1YBL060W 2064 nt2.28□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 SSQ1YLR369W 1974 nt2.28□□□□□ -2.04
SHQ1P40486 NGG1YDR176W 2109 nt2.27□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 UBP2YOR124C 3819 nt2.27□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YJL181WYJL181W 1836 nt2.27□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 snR76snR76 109 nt2.27□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 RFA3YJL173C 369 nt2.27□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YJL202CYJL202C 348 nt2.27□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 MRP49YKL167C 414 nt2.27□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YLR050CYLR050C 486 nt2.27□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 NYV1YLR093C 762 nt2.27□□□□□ -2.05
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