Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CFHR2P36980 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFHR2P36980 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms