Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM5P33992 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCM5P33992 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCM5P33992 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCM5P33992 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM5P33992 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM5P33992 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM5P33992 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM5P33992 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM5P33992 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM5P33992 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM5P33992 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM5P33992 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM5P33992 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM5P33992 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM5P33992 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM5P33992 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM5P33992 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM5P33992 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM5P33992 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM5P33992 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM5P33992 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM5P33992 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM5P33992 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM5P33992 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM5P33992 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM5P33992 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM5P33992 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms