Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC27P30260 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC27P30260 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC27P30260 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC27P30260 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CDC27P30260 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms