Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2E2P29084 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2E2P29084 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms